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美国发现更具传染性的新冠毒株!疫苗研制可能比预想更难
[ 作者:佚名    转贴自:https://kandianshare.html5.qq.com/v2/news/4606010970370117954    点击数:32    更新时间:2020/5/10    文章录入:LA ]
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美国发现更具传染性的新冠毒株!疫苗研制可能比预想更难

腾讯医典2020-05-08

这两天,一个关于新冠病毒的研究刷爆网络:美国科学家发现了一种新的新冠病毒毒株,而且似乎比新冠病毒大流行初期传播的毒株更具传染性。

4月30日,预印本网站BioRxiv上传了这篇来自美国洛斯·阿拉莫斯国家实验室(Los Alamos National Laboratory,LANL)的论文[1],题目翻译成中文是《刺突蛋白突变揭示了一种更具传染性的新冠病毒的出现》。

科研人员分析了全球共享流感数据倡议组织(GISAID)数据库里的4535个新冠病毒核酸序列,发现由于刺突蛋白突变,一种更具传染性的新冠病毒毒株(G614)从2月初开始,就在欧洲传播并且迅速蔓延,目前已经成为全球最主要的毒株。


上面这段话有一些专业名词,可能听着比较拗口。为了更好地理解全文,我给大家先简单解释一下。

GISAID

全称是“全球共享流感数据倡议组织”,总部位于德国慕尼黑,数据来源于全球14000名研究人员和1500个机构的共享,是目前全球最大的流感及新型冠状病毒数据平台。

在新冠疫情期间,全球各地的科研人员做完病毒的基因组测序,便将数据上传至GISAID,这样通过大数据分析,我们就知道哪种毒株正在哪个区域流行。


(新冠病毒结构,外面那些粉红色的凸起就是刺突蛋白。图片来源:美国CDC[2])

刺突蛋白

病毒有其特定的入侵物种,就像一把钥匙配一把锁(当然也有万能钥匙,可以开很多把锁)。新冠病毒和SARS病毒同属冠状病毒,两者身上的刺突蛋白(Spike protein)就像一把钥匙,可以打开宿主细胞上的锁(一种名为ACE2的受体蛋白),从而侵入宿主。

刺突蛋白一旦发生变异,可能会显著影响它与宿主细胞的连接,引起病毒传播力的变化。

例如,之前德州大学奥斯汀分校的研究表明[3],新冠病毒的刺突蛋白和ACE2的解离常数(KD,数值越小,亲和力越大)是14.7nM,而SARS病毒的则是325.8nM,这也在一定程度上解释了,为何新冠病毒的传染性比SARS更高。

D614G

新冠病毒是一种RNA病毒,RNA病毒天生爱突变。

D614G这个名字是这么来的:由于一个碱基突变,原来614号位点编码天冬氨酸(Asparagine,单字母缩写D)的基因,突变成编码甘氨酸(Glycine,单字母缩写G)了,这种突变就简写为D614G。

咱们把原来的毒株称为D614(最早在武汉分离出来),把突变后的毒株称为G614(或者D614G)。

大家还需要知道一点,并非所有的突变都有生理学意义,只有极少部分突变可能会显著影响病毒的传播力和致病力。

那么,从美国的这篇论文中,我们能获得的信息有哪些?

1. 先来看G614病毒株的规模(几种毒株中,只有G614毒株在全球大流行)

首先,G614毒株最早在今年3月份被发现,并上传至GISAID。这比实际出现的时间大约延迟2周左右,在最初上传时,这个毒株只出现了7次。

实际上,各地都有不同的毒株出现。但在后续的跟踪研究中,研究人员发现并且流行的,G614在3月份以惊人的速度增长并蔓延至全球。

很多新冠病毒毒株都是在某些地区发现并且流行的,例如,在中国发现H49Y毒株,美国华盛顿发现G476S毒株,冰岛发现A831V毒株。但唯独G614毒株是全球大面积流行的。

在3月1日前,G614基本集中在欧洲,其他地区所占的比例不大,但后来,G614扩散至全球,比例越来越大。


(图片来源:BioRxiv)

注意看上面这2张图,原始的D614(黄色)逐渐被后来的G614(蓝色)替代,也就是说,G614逐渐成为后来许多国家的主要流行株。

2.我们再看看它的毒力(G614传播力最强)

大家通过上面的数据也能猜到,G614的传播能力肯定是高于普通新冠毒株。实际上的确如此。

科研人员发现,G614的突变使得病毒更易与受体细胞发生融合,增加其传染性。在核酸检测当中,G614也显示出比D614更高的病毒载量。


[左轴代表核酸检测中的PCR循环次数,从0到40次,越早出现(越低),就说明原本的病毒载量越高。图片来源:BioRxiv]

这一点,和之前李兰娟团队发表的研究有吻合之处。李兰娟团队的研究发现[4],用不同变异的病毒株感染实验室的细胞,病毒载量差异可高达270倍。

然而,让我们感到幸运的一点是,从目前的研究来看,虽然G614的传播力更强、病毒载量也更大,但它的毒力似乎没有明显提升,因为这一突变并未增加感染者住院的概率。


(感染G614和D614毒株的门诊患者、住院患者和ICU患者的比例。可以看出,G614突变并未增加感染者住院的概率。图片来源:BioRxiv)

对于我们来说,这个研究最主要的意义是什么?

我个人认为,它在提示,新冠疫苗的研发,可能会比我们想象得更加困难。

疫苗的本质是一种抗原,但它没有致病能力(或者非常弱),它会刺激身体产生抗体,对抗特定的病原体。现在许多疫苗都是采取病原体的一部分(比一段核酸、一个蛋白或一个亚基)进行研制。

那么,科研人员自然希望病原体的这一部分尽量稳定,这样疫苗研发的成功率就比较大。这就好比你仅凭着一张照片去机场接人,如果这个人的衣服、发型都和照片上一致,那你可能会比较容易认出来,反之就困难多了。

同样的,对于比较稳定的病毒,疫苗相对来说更容易研发。比如,同样是肝炎病毒,乙肝疫苗几十年前就已经出现了,但丙肝就没有疫苗。因为乙肝病毒是DNA,而丙肝病毒是RNA,后者极易突变,导致疫苗的研发困难重重。

再比如流感疫苗,流感病毒也是一种RNA病毒,也很容易突变,每年流行的毒株可能都不一样。所以,虽然我们很早就有流感疫苗了,但也不是一劳永逸的,它需要每年都接种,并且有效率大概只有40%~60%[5]。


(流感疫苗的有效率数据。图片来源:美国CDC)

回到新冠病毒上面,需要了解的一点是,人类至今没有成功研发过任何一支冠状病毒疫苗。SARS过去17年了,也没有SARS疫苗上市。对于埃博拉疫苗,当时世界卫生组织(WHO)给了最高级别的支持,国际上几个制药巨头全都上了,结果硬是折腾了6年,世界上第一支埃博拉疫苗才在去年年底上市。

因此,新冠疫苗的研发对于全人类来说,都是一个挑战。我们发现,新冠病毒的突变也许比预想的更多。在短短两个月的时间内,全球以D614病毒株为主的疫情就变成了以G614为主,并且这个突变是位于大多数在研疫苗所依赖的刺突蛋白上。

这个点突变是否影响到疫苗研发的成败?这其实是个“玄学”问题。这就好比,你家汽车的发动机里有一个螺母松动了,会不会影响驾驶呢?没人说得准,有可能你这车继续开个几万公里都没毛病,也有可能没过几天就爆缸了。

最后说几句我自己的想法。初步控制疫情,可以靠国家的严格隔离和做好个人的卫生工作,但长远来看,还是需要依靠疫苗。只有疫苗才能实现真正意义上的“群体免疫”,从而遏制病毒扩散。

新冠疫情已经持续数月之久了,我们早已不是一开始的一无所知。我们在12月底就完成了病毒基因组测序,制定了多版可靠的诊疗方案;我们深入分析了病毒的分子结构,获得了多种抗病毒药物的临床数据,也已经有了高效并且可以大规模测试的核酸试剂盒。

但无论在任何时候,我们都不要轻视新冠病毒,也不要妖魔化他国的防控策略。目前全人类的头号敌人是病毒,而这个敌人,比我们预想的更加强大。

参考文献

[1]https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.29.069054v1.

[2]https://neoskosmos.com/en/157431/coronavirus-remains-a-stranger-to-greek-shores-but-flu-claims-21-lives/.

[3]https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.11.944462v1.

[4]https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.14.20060160v2.

[5]https://www.cdc.gov/flu/vaccines-work/2018-2019.html.

【主创团队】

编辑:张杰、王艳

排版:李永敏 /运营:郑敏群、赵亚楠

统筹:张宁

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