首先，松果体是人体的第三只眼睛。说人体有第三只眼睛，似乎是不可思议。其实，生物学家早就发现，早已绝灭的古代动物头骨上有一个洞。起初生物学家对此迷惑不解，后来证实这正是第三只眼睛的眼框。研究表明，不论是飞禽走兽，还是蛙鱼龟蛇，甚至人类的祖选，都曾有过第三只眼睛。只不过随着生物的进化，这第三只眼睛逐渐从颅骨外移到了脑内，成了“隐秘的”第三只眼。尽管松果体移入了黑洞洞的颅腔内。“深居简出”、“与世隔绝”，不能直接观察五光十色的大千世界。但由于它曾经执行过人类第三只眼晴的功能，凭着它原来的一手“绝活”，仍然能感受光的信号并作出反应。例如人们在阳光明媚的日子里会感到心情舒畅、精力充沛、睡眠减少。反之，遇到细雨连绵的阴霾天气则会情绪低沉、郁郁寡欢、常思睡眠。这一现象正是松果体在“作崇”。

　　因为松果体细胞内含有丰富的5一羟色胺，它在特殊酶的作用下转变为褪黑激素，这是松果体分泌的一种激素。研究发现，褪黑激素的分泌受到光照的制约。当强光照射时，褪黑激素分泌减少；在暗光下褪黑激素分泌增加。而人体内褪黑激素多时会心情压抑，反之，人体内的褪黑激素少时则“人逢喜事精神爽”。由此看来，人的情绪受光的影响就不足为奇了。

　　其次，松果体是人体的“生物钟”的调控中心。由于褪黑激素的分泌受光照和黑暗的调节，因此，昼夜周期中光照与黑暗的周期性交替就会引起褪黑激素的分泌量相应地出现昼夜周期性变化。实验证实，褪黑激素在血浆中的浓度白昼降低，夜晚升高。松果体通过褪黑激素的这种昼夜分泌周期，向中枢神经系统发放“时间信号”，转而引发若干与时间或年龄有关的“生物钟”现象。如人类的睡眠与觉醒、月经周期中的排卵以及青春期的到来。新近发现，人体的智力“生物钟”以33为周期进行运转，情绪“生物钟”为28天，体力“生物钟”为23天。这三大生物钟的调拨也是由松果体来执行的。

　　松果体分泌的激素——褪黑激素能够影响和干预人类的许多神经活动，如睡眠与觉醒、情绪、智力等。很显然，松果体在神经信号与激素信号之间扮演着“中介人”的角色。因此，松果体在人体内执行着一个神经——激转换器的功能。这也是松果体的第三个功能。

　　然而，我们相信，松果体的功能远不致此，我们对松果体的认识还很肤浅。由于它深埋在颅腔内，使我们对它的研究增添了客观上的困难。但不管怎样，随着研究的深入，它的“庐山真面目”终究会显现在人们面前。

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　　关于第三只眼的说法由来已久，在东方的许多宗教仪式上，人们习惯在双眉之间画上第三只眼，认为这样便可获得与宇宙进行直接交流的通道。古希腊哲学家认为，第三只眼位于大脑中心部位，将其比喻为宇宙能量进入人体的闸门。直至今日，现代医学对第三只眼的研究也从未停止过。不久前，俄罗斯《总结》周刊的一篇文章对“第三只眼”作了详尽报道。古人类学家别洛夫认为，这一器官退化痕迹残留在大脑半球下。“退化的眼睛”与松果体类似，是一个不大的非对称器官。

　　出现在胚胎发育两个月时，即晶体、感光器和间脑区域的神经细胞形成阶段。奇怪的是，它刚一出现，马上就开始退化。著名的海克尔生物基因定律为此提供了最有力的证据。根据这一定律，胚胎在很短的时期内会经历其所属物种的整个进化史。即人类在胚胎时期能够出现我们的先祖所具备的某些形态特征。人类学家认为，人体的某个器官会发生退化，然后便不复存在。从古代两栖动物的进化中可以发现它们同样伴有退化。新西兰的斑点楔齿蜥已经存在了2亿年，它的颅骨上有很小的眼眶，在一层透明的膜下隐藏着一只真正的眼睛。古生物学家发现，许多灭绝的爬行动物头顶都有眼睛，它是这些动物视觉器官的重要补充。正是因为具有这一独特的器官，爬行动物才对地震、磁暴和火山爆发等自然灾害非常敏感。

　　动物的第三只眼确实能够物尽其用，而且还可以保护自身安全，但人要它来做什么呢？别洛夫认为，先知者眼前出现的画面，正是松果体作用的结果。大脑将宇宙中的能量汇集起来，而身体与地面振荡保持一致。所以，松果体能够从宇宙获得超凡的想象力，将其化作神经冲动，到达丘脑下部。然后，这些信号随着神经进入视网膜，视网膜上便出现虚拟的图像，同时，图像以神经冲动的形式继续传入大脑的视觉皮层，产生意识。未卜先知的画面通常是闭眼而非睁眼时出现的。未卜先知的能力应该是在我们的祖先失去了头顶上的眼睛后，作为对这一消失器官的补偿而出现的。

　　别洛夫认为，祭司充分利用了这一退化器官。为发挥第三只眼的功能，他们用钻石做头饰，在宗教仪式时佩戴。或许，宇宙的神秘能量正是通过宝石透明剔透的结构，以光束的形式汇聚到头顶。电磁波到达松果体并作用于其组织，水晶起的作用与晶体类似，只是它吸收的并非普通光线，而是宇宙能量。在宗教仪式上中，祭司正是借助人为的第三只眼，洞悉一切。

　　在旧石器时代末期，一些宗教学说的信徒通常会被施以脑颅环锯术，他们的头顶会被挖出不同形状的洞。环锯术的被施予者都是祭司的候选人，不知这是不是为了减轻宇宙神秘能量进入松果体的难度。

　　古代曾经有能量中心之说，这一中心很早就被冠以第三只眼之名，因为它能够接收和反映出具体的图像，看来古人的结论不无道理。

　　松果体是否是第三只眼睛，它是否具有特殊功能目前尚无定论。